Keluarga Batman telah kembali ke masa kini untuk menemukan bahwa Jepang telah lenyap, dan sebuah pulau raksasa – Hinomoto – sekarang berada di langit di atas Kota Gotham. Di puncaknya terdapat Yakuza, sekelompok orang berkekuatan super yang memerintah tanpa kehormatan atau kemanusiaan dan terlihat mencurigakan seperti Justice League. Sekarang, terserah kepada Batman dan sekutunya untuk menyelamatkan Gotham!
